שיטות נפוצות לניקוי הילוכים כוללות ניקוי החלפת כוח הכבידה, ניקוי החלפת נוזלים, ניקוי דינמי במכונה וניקוי פירוק. ניקוי החלפת כוח הכבידה הוא פשוט ובעלות-נמוכה אך לא מספיק יסודי, בעוד שניקוי החלפת נוזלים הוא ההפך. ניקוי דינמי במכונה מסיר אבנית ביעילות ללא פירוק, בעוד שניקוי פירוק הוא יסודי אך מורכב. בעת הניקוי יש לבחור חומר ניקוי מתאים, לשלוט בזמן ובלחץ, לבדוק היטב לפני ואחרי הניקוי, ומומלץ לנקות כל 40,000-60,000 קילומטרים בהתאם למצב הרכב בפועל.
ניקוי החלפת כוח הכבידה הוא פשוט יחסית לתפעול. ראשית, החנה את הרכב על משטח ישר, חממו מראש את המנוע, ולאחר מכן שחררו את בורג הדימום, כדי לאפשר לנוזל ההילוכים הישן לזרום החוצה באופן טבעי על ידי כוח הכבידה. עם זאת, שיטה זו יכולה להחליף רק כ-40%-50% מהנוזל הישן מכיוון שהמבנה הפנימי של תיבת ההילוכים מורכב, וחלק מהנוזל הישן בפינות מסוימות אינו יכול להתנקז לחלוטין על ידי כוח הכבידה.
ניקוי החלפת נוזלים משתמש בציוד מיוחד להחלפת נוזלים. לאחר חיבור הציוד לתיבת ההילוכים, הנוזל החדש מונע על ידי מכונת החלפת הנוזלים להחלפה מלאה עם הנוזל הישן, תוך החלפת כ-90%-95% מהנוזל הישן, וכתוצאה מכך אפקט ניקוי טוב יותר. עם זאת, שיטה זו כרוכה בציוד יקר, תפעול מורכב ודורשת צוות תחזוקה מיומן ביותר.
ניקוי מכונה דינמי משתמש בציוד מיוחד כדי להחדיר נוזל ניקוי לתיבת ההילוכים, להזרים אותו במהלך פעולת הרכב. התהליך כולו אינו מצריך פירוק של התמסורת, הסרה יעילה של לכלוך פנימי ולכלוכים תוך מזעור השפעה על רכיבים פנימיים עדינים.
ניקוי פירוק היא השיטה היסודית ביותר, פירוק ישיר של התמסורת לצורך בדיקה וטיפול מקיפים בחלקים הפנימיים. עם זאת, שיטה זו דורשת טכנאים מומחים, היא לא רק יקרה, אלא שהרכבה מחדש עשויה גם לסכן את איטום התמסורת, מה שעלול להוביל לנזילות שמן ולבעיות אחרות מאוחר יותר.
